Nature:粘连蛋白释放特异性Wapl促进V基因重排的机制

肝细胞核内的一些生物学反复，比如V(D)J芳基，通常是由等位基因组可视化构象所其会，除此以外等位基因组区室（compartments）、上同调方面内部结构域（topologically associated domains， 简称TADs）和核糖的环（chromatin loop）等。TADs是由核糖的环浸入（chromatin-loop extrusion）所形成的，而这一反复发挥作用圆的环形似的牙龈蛋白多肽（cohesion complex）。与之相对其所的是，牙龈蛋白扣留特异性Wapl可以放宽核糖的环的衔接（loop extension），从而起到负向其会的效用。

一系列免疫反其所的产生，组成了体液免疫抗击外来病原体的主要含有，而免疫反其所的自然，是由V(D)J芳基所充分利用的，这一反复，发挥作用Pax5所内皮肝细胞的2.8Mb窄免疫球蛋白重链（immunoglobulin hey chain，简称lgh）肽链的外周。然而在此前体B肝细胞（pre-B cells）里面，Pax5是如何其会lgh外周的，仍旧不得而知。

近日，来自奥地利Vienna Biocenter的Meinrad Busslinger分析组在Nature上发表二本书Wapl repression by Pax5 promotes V gene recombination by Igh loop extrusion的书评，揭示Pax5通过诱发Wapl，从而充分利用对lgh的其会。

因为核糖的环浸入发挥作用麦芽糖连蛋白多肽，所以，所作首先分析在此前体B肝细胞里面，牙龈蛋白多肽各组分的表述前提发生推移。所作断定，在RNA高度上，相较于其他大类的免疫肝细胞，此前体B肝细胞和原B肝细胞（pro-B cell）的的Wapl高度上调了四倍。蛋白质高度也有相同的断定。这些结果显然，麦芽糖连蛋白扣留特异性Wapl的上调，很或许提高麦芽糖连蛋白在核糖上的存留小时。

有报道表明，Pax5可以其会lgh肽链外周，所作接下来探讨，Pax5前提可以负面影响Wapl在此前体B肝细胞里面的表述。所作通过Pax5基因组缺陷豚鼠断定，缺失了Pax5的此前体B肝细胞，Wapl的mRNA高度提高了4~6倍。另外，此前体B肝细胞里面，Wapl上存在2个Pax5融合肽链P1和P2，而在成熟的B肝细胞里面，融合肽链减缓至1个（不存P2）。这些结果所述，在此前体B肝细胞里面，Pax5可以诱发Wapl高度。

在P1敲除豚鼠里面，骨髓里面的B肝细胞发育都是停留在此前体B肝细胞前期，这所述，B肝细胞发育是倍受Wapl上Pax5融合肽链P1所其会的。另外，通过VDJ测序，所作断定，P1敲除的豚鼠，此前体B肝细胞里面VDJH的芳基比例夙着减缓。而在Pax5敲除豚鼠里面，也同样断定相同的反常，并且，Pax5豚鼠lgh肽链能够进行外周。这些结果所述，Wapl上的Pax5融合肽链P1可以其会lgh核糖的环浸入。

最后，所作关注Pax5对Wapl的诱发，前提会负面影响此前体B肝细胞整个等位基因组的内部结构。所作断定，只有在B肝细胞发育的早期前期，Pax5可以负面影响麦芽糖连蛋白在核糖上的驻留小时。并且，与正常的此前体B肝细胞相较，Pax5敲除豚鼠的此前体肝细胞和P1，P2敲除的此前B肝细胞，其TADs里面核糖的环的形成高度夙着减缓；与此相对的是，广袤段的核糖外周，从而形成等位基因组间隔的高度，却大为下降。这些结果所述，在原B肝细胞里面，Pax5的融合肽链P1所其会的Wapl高度减缓，明夙负面影响了整个肝细胞的等位基因组内部结构。

综上所述，所作断定，在此前体B肝细胞和原B肝细胞里面，Pax5可以诱发麦芽糖连蛋白扣留特异性Wapl的表述，从而延窄麦芽糖连蛋白在核糖上的驻留小时，进而促进核糖的环浸入高度的下降。这一反复是通过Wapl上的Pax5融合肽链P1充分利用的。而且，Wapl表述高度的减缓，可以引发等位基因组内部结构的结构上推移，这也是此前体B肝细胞里面发生高高度的V基因组芳基的或许原因之一。

值得一提的是，就在这篇NatureAPP后的次日，可不刻本bioRxiv上在线公开发表了来自哈佛大学Frederich Alt实验室二本书“Loop Extrusion Mediates Physiological Locus Contraction for V(D)J Recombination”的相同工作，同样证明了Wapl通过负面影响核糖的环浸入负面影响基因组芳基的关键效用。

原始记事：

Louisa Hill 1, Anja Ebert 1, Markus Jaritz 1, et al.Wapl repression by Pax5 promotes V gene recombination by Igh loop extrusion.Nature. 2020 Jul 1. doi: 10.1038/s41586-020-2454-y.